При этом файл импортируется в базу на другом сервере превосходно, проблем никогда не было. Единственное, что потенциально может оказывать влияние в данном случае (при условии, что работаете Вы через phpmysql) — это кодировка собственно интерфейса phpmysql. Попробуйте использовать разные кодировки и языки интерфейса phpmyadmin — скорее всего, результат будет разный. Я бы попробовал переключить phpmysql сначала в анлгийский язык, затем в русский с разными кодировками.